L’origine della crisi è da ricercare nel dehubbing di Alitalia: quando infatti la compagnia di bandiera ad inizio 2008 decise il radicale ridimensionamento dei voli, si è manifestata la necessità di sostenere la crisi occupazionale che avrebbe colpito il sistema economico legato allo scalo della brughiera. L’aeroporto è in parte riuscito a recuperare una buona quota del traffico passeggeri e merci ricevendo l’interesse di numerose compagnie.
Il limite temporale fissato per l’utilizzo delle risorse, utilizzate nel 2008 e 2009 solo in parte, era il 31 dicembre 2009. L’assessore della Provincia di Varese Alessandro Fagioli, il collega di Milano Del Nero e l’assessore regionale Rossoni hanno ottenuto dal Ministero del Lavoro l’autorizzazione a continuare ad utilizzare le risorse disponibili per gli ammortizzatori sociali anche nel 2010.